目前国人渐渐提高了对呼吸机的认识，随着家用呼吸机的使用越来越广泛，人们也慢慢的认识到家用呼吸机消毒的重要性。家用呼吸机是直接跟我们人体接触的，所以对呼吸机的消毒就显得尤为重要。
呼吸机消毒的一般方法，两种呼吸机的结构大同小异，可分三部分来进行消毒。
面罩、管路、直接与SARS病人呼吸系统相连部分，是受污染最直接、最严重的部分，需要更换或进行浸泡消毒，做到万无一失。管路、面罩等耗材，如属价格低廉的，可按一次性医用废弃物销毁处理。
呼吸机内部的气路系统是吸人室内被污染空气的部分，可以用环氧乙烷熏蒸法或是利用可以杀死SAILS病毒的气体，让其通过气路系统进行消毒。
电路、机壳、控制部分，也受到室内空气的污染，这部分可以用防腐、防水的消毒剂进行熏蒸、喷雾、擦洗的方法。由于各个厂家的呼吸机型号不一样，消毒后，电路指标应符合国家CB97061管理和决策提供及时准确的数据信息。标准，即医用电子仪器的安全标准。
其实家用呼吸机相比医院大型呼吸机来说，构造相对简单些，但是消毒的过程并不简单，必须使用专业的消毒器械和无水消毒产品，由于受呼吸机内部设备构造相对复杂问题的影响，所以要求消毒人员必须对呼吸机的基本结构要熟悉，才可以保证呼吸机在开机后的整个消毒过程中对机器内部不会造成不必要的损坏，所以建议大家最好寻找专业的呼吸机维修和保洁公司，国内可以提供呼吸机消毒的公司也仅有几家，他们多是集中在一些大型城市，比如说在广州就有。